劳务外包人员的党员组织关系应当转入工作单位。
中办《关于加强新形势下发展党员和党员管理工作的意见》(十六)改进对流动党员的管理。对劳务派遣工中的流动党员，一般以用人单位党组织管理为主，劳务派遣单位党组织和户籍所在地党组织密切配合、主动联系，将他们纳入党组织有效管理之中。

个人认为，此类情况将该员工的党员组织关系转到长期居住地为宜。