这种情况，建议你联系原部队，看是否能出具证明或找到原件。

找你部队和军校的党组织。协调好，可以出相关证明，并按照相关要求补办。

　根据中组部发展党员工作实施细则和有关文件精神，按照以下程序进行，一般是由组织关系所在地进行补办的。
　　一、调查核实，确认党员身份
　　当发现某位党员的档案里找不到《入党志愿书》时，党支部要做的第一件事是：调查核实，确认其党员身份。党支部要通过派人前往其入党地调查或函调等形式，核实其党员身份的真实性。主要是防止极个别心术不正的人，利用工作安排、工作调动、毕业分配、复员转业之机，买通有关人员，并不是党员，却开出“党员组织关系介绍信”，骗取党员身份。如发现这种情况，就要一追到底，严肃处理。因此，党支部只有在确认该同志党员身份的前提下，才能为其补办《入党志愿书》。
　　二、严肃认真，收集证明材料
　　为了使补办的《入党志愿书》足以证明其党员身份，既对党员个人负责，也对党组织和历史负责，因此，必须收集如下主要证明材料：
　　1、本人有关入党情况说明。请补办《入党志愿书》的同志写清何时何地入党，入党介绍人是谁，党支部书记是谁等情况。
　　2、入党介绍人的证明材料。要写清何时何地介绍其入党等细节。（如两位入党介绍人都去世或无法查找，则应有两名以上熟悉当时情况的党员的证明材料）。
　　3、其入党所在党支部负责人的证明材料（证明人原则上要党支部书记，如无法找到，可找其他党支部委员）。要写清当时接收其入党的情况。
　　4、党支部讨论接收该同志为预备党员、讨论预备党员转正的支部决议复印件或摘抄件。
　　5、基层党委讨论接收该同志为预备党员、讨论预备党员转正的党委决议复印件或摘抄件。
　　上述除本人的情况说明之外的4项证明材料，都必须加具公章。同时，个人提供的证明材料，要写明提供材料人当时的身份；复印件或摘抄件则要写清材料出处、摘抄人或复印人，以示负责。
　　三、按照程序，做好补办手续
　　在确认党员身份并取得上列4项证明材料的基础上，由党员现在所在的党支部负责为其补办《入党志愿书》。程序如下：
　　1、在《入党志愿书》封面上写明：“因《入党志愿书》丢失，×年×月×日补办”，并加具党支部或单位公章。
　　2、让补办人如实填写好《入党志愿书》第1页至第6页。填表时应注意，“本人经历”、“奖励或处分”、“家庭主要成员”、“主要社关”等栏目应反映入党当时的状况，入党后发生的情况不应填写。但第6页末尾的日期应填入党时的日期，再填上补办的日期，并写上“补填”字样。
　　3、将上列5项证明材料装贴在第7页上。
　　4、召开支部大会，作出同意补办《入党志愿书》的决议。支委会要负责地详细地向全体党员报告调查核实情况、支委会审查证明材料情况、支委会审查证明材料情况，在此基础上，形成支部决议，并将“决议”写入《入党志愿书》第8页中。“决议”的标题应定明“同意×××同志补办《入党志愿书》的决议”。“决议”中要写明党龄从何年何月何日算起。支部书记应签名。
　　5、党委会作出同意补办《入党志愿书》的决议，并写入《入党志愿书》第10页“党委审批意见”栏中（标题内第8页支部决议栏），由党委书记签名，并加具公章。　
　　6、将补办的《入党志愿书》归入党员个人档案。

入党申请书和转正申请书是由党员本人书写的。按照党员档案归档要求，应该在其转正后归档入党员人事档案中。
根据问题描述，应该先联系原部队党组织积极找寻原件，如无法找回原件的，首先应该由原党组织出具丢失的情况说明，如果也没有办法补说明的。可以由党员本人手写情况说明情况说明，积极回忆当时递交入党申请书和转正申请书的情况，时任支部书记、支部培育情况。
以上说法仅供参考，具体还需提供哪些材料或者说明的，建议咨询你们上级党组织确定。
党员档案是不保存在党员本人手里的，丢失材料非党员本人的责任，且过程复杂时间较久无法追溯的，希望接收党组织不要以此为由拒绝党员组织关系转接，更多给予同志间的关爱和帮助。

根据你所述情况，建议经现所在党组织同意，补写入党申请书和转正申请书，落款时间应写当时的时间，再写明补写的原因和日期。