组织关系是否留在学校取决于你是否继续在学校的管理范围之内，如果人员已经不在学校了，应当将组织关系转到工作单位，如果工作单位没有党组织，应当转到工作单位所在地的党组织，以便参与党的组织生活和缴纳党费，至于党员档案是可以跟人事档案放在一起的，后面如果你的工作单位有权接收党员档案的话也可以去档案存放地（人才市场）调取出来的，需要工作单位党委出具手续才能调走。

这种情况建议你将组织关系转到你党员档案所在地。方便日后组织关系转出。