由于早期入党资料填写不规范，这种情况还是存在的。这种情况一般启动调查，若确实已经召开了党员大会，则补充材料。如果没有召开会议的，需要补一个转正程序。

《中国共产党发展党员工作细则》　第三十二条规定，预备党员预备期满，党支部应当及时讨论其能否转为正式党员。认真履行党员义务、具备党员条件的，应当按期转为正式党员；
       需要继续考察和教育的，可以延长一次预备期，延长时间不能少于半年，最长不超过一年；
       不履行党员义务、不具备党员条件的，应当取消其预备党员资格。
       预备党员违犯党纪，情节较轻，尚可保留预备党员资格的，应当对其进行批评教育或延长预备期； 情节较重的，应当取消其预备党员资格。
       预备党员转为正式党员、延长预备期或取消预备党员资格，应当经支部大会讨论通过和上级党组织批准。
       因此，请您查看党员大会记录，了解不同意转正的原因是什么，大会意见是延长预备期还是取消预备党员资格，根据党员大会的决议做好后续工作，不管是延长预备期还是取消预备党员资格，都要报上级党组织批准。
      如果党员大会没有作出延长预备期或是消预备党员资格的决定，应及时提请党员大会讨论作出决定，并报上级党组织批准。你这个问题建议找你的上级党委咨询看看，听取党委给予意见来处理。