组织部直接发文撤销即可。党委自己无权撤销自己。

都行。不过组织部是没权利直接批复的，必须过上级的党委或党组会。
具体说一下两种操作方式。
1、和上级组织部沟通好了，由上级组织部直接向上级党委或党组会上报议题，就叫做《关于调整XXX单位党组织设置的议案》，写明撤销哪个党委，成立哪个党支部，党委或党组会通过后直接发文
2、和你说的一样，先打请示撤销党委成立党支部，上级党委或党组会通过后发文

可由上级党组织直接作出决定。