组织在纪律审查中发现党员有违法行为，包括受到行政拘留，应当首先依据行政处罚决定所认定的事实、性质和情节来进行评估。这是决定给予何种党纪处分的基础。根据《中国共产党纪律处分条例》第二十九条的规定，对于有违法行为的党员，如果其行为影响了党的形象，损害了党、国家和人民的利益，党组织应当视情节轻重给予党纪处分。根据《中国共产党纪律处分条例》第八条的规定，对党员的纪律处分种类包括：警告、严重警告、撤销党内职务、留党察看、开除党籍。这些处分种类从轻到重，为党组织提供了灵活的处理方式。除了党纪处分外，党组织还可以视情况给予组织处理。组织处理包括调离岗位、责令辞职、免职、降职等。这些处理措施旨在保护党的形象，维护党的纪律，同时促使受处理党员认识到自己的错误，改正行为。党组织作出党纪处分或者组织处理决定后，如果司法机关、行政机关等依法改变了原生效判决、裁定、决定等，且这些改变对原党纪处分或者组织处理决定产生了影响，党组织应当根据改变后的生效判决、裁定、决定等重新作出相应处理。

《中国共产党纪律处分条例》第三十三条第二款就规定，“党员依法受到政务处分、行政处罚，应当追究党纪责任的，党组织可以根据生效的政务处分、行政处罚决定认定的事实、性质和情节，经核实后依照规定给予党纪处分或者组织处理。”